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RNA分析類

           
RNA draw 1.1 b2 RNA draw 1.1b2 RNA二級結構分析軟件。
RNAstructure 5.7 Unix平臺軟件mfold的java版本。
RnaViz 2.0 界面友好的RNA二級結構圖繪制程序。可生成發表質量的二級結構圖,可顯示一些特殊結構。
loopDloop 2.07b Java語言寫成的繪制RNA二級結構的軟件,需要安裝JAVA虛擬機。
Circles 0.1.1 使用比較的方法分析RNA二級結構軟件,并以標準格式輸出預測的二級結構。
SStructView 1.2 用JAVA腳本語言寫成的RNA二級結構顯示軟件。
Vienna RNA Package 2.1.9 維也納大學RNA二級結構預測與比較軟件包。
XRNA 1.2.0b 基于java的生成、顯示、注釋RNA二級結構的軟件,可很容易地編輯、修改、生成發表質量的RNA二級結構圖。
PseudoViewer 3.0 RNA二級結構顯示軟件。
OligoEngine 2.0 RNAi設計軟件。
pknotsRG 1.3 預測RNA二級結構軟件,包括pseudoknots(假扭結)結構。
RNAshapes 2.1.6 分析RNA二級結構軟件。
miRanda 201008 查找基因組中潛在的RNA位點軟件。軟件運行需要安裝JAVA運行環境。
RNAz 2.1 預測結構保守熱穩定RNA結構,可用于基因組中篩查功能RNA結構等等。
RnaFamily java編寫的用于顯示一個RNA分子族的所有二級結構小軟件。
RNApasta 1.01 Java語言所寫的比對和結構注釋RNA序列統計分析工具。
RnaDv 1_0 RNA二級結構顯示軟件
Assemble2 1.2 構建和研究RNA結構的圖形軟件
VARNA 3-93 RNA二級結構顯示插件
nocoRNAc 1.23 非編碼RNA鑒定軟件
RnallViewer 1.0.1 RNA分析顯示軟件
  以上軟件,除特別注明外,均在生物軟件DVD光盤1中。
在線工具  
siDirect 2.0 siRNA在線設計軟件。
tRNAscan-SE 1.21 在基因組數據中尋找tRNA基因的在線工具。

 

 

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